Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nufip1Q9QXX8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms