Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copg2Q9QXK3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Copg2Q9QXK3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Copg2Q9QXK3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg2Q9QXK3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg2Q9QXK3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg2Q9QXK3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg2Q9QXK3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg2Q9QXK3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg2Q9QXK3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg2Q9QXK3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg2Q9QXK3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg2Q9QXK3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg2Q9QXK3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg2Q9QXK3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg2Q9QXK3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg2Q9QXK3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg2Q9QXK3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg2Q9QXK3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg2Q9QXK3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg2Q9QXK3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg2Q9QXK3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg2Q9QXK3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copg2Q9QXK3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms