Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms