Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt17Q9QWL7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms