Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PolkQ9QUG2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PolkQ9QUG2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PolkQ9QUG2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PolkQ9QUG2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PolkQ9QUG2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PolkQ9QUG2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PolkQ9QUG2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PolkQ9QUG2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PolkQ9QUG2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PolkQ9QUG2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PolkQ9QUG2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PolkQ9QUG2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PolkQ9QUG2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
PolkQ9QUG2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PolkQ9QUG2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PolkQ9QUG2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PolkQ9QUG2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PolkQ9QUG2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PolkQ9QUG2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PolkQ9QUG2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PolkQ9QUG2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PolkQ9QUG2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PolkQ9QUG2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PolkQ9QUG2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PolkQ9QUG2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PolkQ9QUG2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms