Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms