Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM93

Arl6ip4, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip4Q9JM93 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arl6ip4Q9JM93 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Arl6ip4Q9JM93 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arl6ip4Q9JM93 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl6ip4Q9JM93 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms