Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf1Q9JM58 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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