Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc4apQ9JLV2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc4apQ9JLV2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc4apQ9JLV2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc4apQ9JLV2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc4apQ9JLV2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpc4apQ9JLV2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpc4apQ9JLV2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpc4apQ9JLV2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpc4apQ9JLV2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc4apQ9JLV2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms