Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms