Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd2apQ9JLQ0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms