Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms