Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms