Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms