Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmx1aQ9JKU8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188.6 ms