Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms