Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
AtrQ9JKK8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms