Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms