Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms