Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR5

Akip1, A-kinase-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akip1Q9JJR5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Akip1Q9JJR5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Akip1Q9JJR5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Akip1Q9JJR5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Akip1Q9JJR5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Akip1Q9JJR5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Akip1Q9JJR5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Akip1Q9JJR5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Akip1Q9JJR5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Akip1Q9JJR5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Akip1Q9JJR5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Akip1Q9JJR5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms