Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms