Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Riox1Q9JJF3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms