Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip1Q9JJ57 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip1Q9JJ57 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip1Q9JJ57 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip1Q9JJ57 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnip1Q9JJ57 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnip1Q9JJ57 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnip1Q9JJ57 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnip1Q9JJ57 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnip1Q9JJ57 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnip1Q9JJ57 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms