Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc12a4Q9JIS8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc12a4Q9JIS8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc12a4Q9JIS8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms