Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms