Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHL1

Slc9a3r2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r2Q9JHL1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms