Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl11Q9JHH5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cxcl11Q9JHH5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
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