Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET54

Palld, Palladin, mousemouse

Predictions only

Length 1,408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PalldQ9ET54 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PalldQ9ET54 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PalldQ9ET54 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PalldQ9ET54 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PalldQ9ET54 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PalldQ9ET54 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PalldQ9ET54 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PalldQ9ET54 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PalldQ9ET54 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PalldQ9ET54 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PalldQ9ET54 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PalldQ9ET54 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PalldQ9ET54 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PalldQ9ET54 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PalldQ9ET54 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PalldQ9ET54 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PalldQ9ET54 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PalldQ9ET54 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PalldQ9ET54 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PalldQ9ET54 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PalldQ9ET54 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PalldQ9ET54 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PalldQ9ET54 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PalldQ9ET54 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PalldQ9ET54 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PalldQ9ET54 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PalldQ9ET54 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PalldQ9ET54 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PalldQ9ET54 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms