Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms