Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms