Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfip11Q9ERA6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tfip11Q9ERA6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms