Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Clstn2Q9ER65 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Clstn2Q9ER65 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms