Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR5

Lime1, Lck-interacting transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lime1Q9EQR5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lime1Q9EQR5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lime1Q9EQR5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms