Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SgshQ9EQ08 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms