Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL6

Mmp1b, Interstitial collagenase B, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1bQ9EPL6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1bQ9EPL6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms