Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn1Q9EPL2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms