Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnft1Q9DCN7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms