Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms