Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med29Q9DB91 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms