Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAF1

1700012A03Rik, RIKEN cDNA 1700012A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700012A03RikQ9DAF1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC12□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC12□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
1700012A03RikQ9DAF1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms