Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9DA42 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9DA42 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9DA42 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9DA42 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9DA42 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9DA42 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9DA42 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9DA42 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9DA42 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9DA42 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9DA42 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9DA42 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9DA42 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9DA42 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9DA42 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9DA42 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9DA42 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9DA42 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9DA42 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9DA42 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9DA42 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9DA42 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9DA42 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9DA42 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9DA42 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9DA42 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9DA42 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9DA42 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9DA42 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9DA42 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9DA42 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9DA42 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9DA42 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9DA42 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9DA42 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9DA42 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9DA42 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9DA42 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9DA42 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9DA42 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9DA42 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9DA42 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9DA42 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9DA42 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9DA42 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9DA42 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9DA42 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9DA42 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9DA42 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q9DA42 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q9DA42 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9DA42 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9DA42 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9DA42 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9DA42 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9DA42 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9DA42 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9DA42 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9DA42 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9DA42 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9DA42 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9DA42 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9DA42 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9DA42 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9DA42 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9DA42 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9DA42 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9DA42 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9DA42 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9DA42 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9DA42 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9DA42 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9DA42 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9DA42 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9DA42 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9DA42 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9DA42 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9DA42 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9DA42 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9DA42 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9DA42 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9DA42 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9DA42 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9DA42 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9DA42 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9DA42 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9DA42 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9DA42 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9DA42 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9DA42 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9DA42 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9DA42 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9DA42 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9DA42 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9DA42 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9DA42 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9DA42 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9DA42 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9DA42 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms