Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Smco2Q9DA21 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Smco2Q9DA21 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms