Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Y7

1700025F22Rik, RIKEN cDNA 1700025F22, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700025F22RikQ9D9Y7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700025F22RikQ9D9Y7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700025F22RikQ9D9Y7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700025F22RikQ9D9Y7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700025F22RikQ9D9Y7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700025F22RikQ9D9Y7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700025F22RikQ9D9Y7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700025F22RikQ9D9Y7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700025F22RikQ9D9Y7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700025F22RikQ9D9Y7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700025F22RikQ9D9Y7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700025F22RikQ9D9Y7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700025F22RikQ9D9Y7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700025F22RikQ9D9Y7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms