Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldnd2Q9D9H2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms