Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms