Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms