Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rexo2Q9D8S4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms