Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S3

Arfgap3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap3Q9D8S3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgap3Q9D8S3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgap3Q9D8S3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgap3Q9D8S3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgap3Q9D8S3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgap3Q9D8S3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgap3Q9D8S3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgap3Q9D8S3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgap3Q9D8S3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgap3Q9D8S3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgap3Q9D8S3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgap3Q9D8S3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgap3Q9D8S3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arfgap3Q9D8S3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arfgap3Q9D8S3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arfgap3Q9D8S3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arfgap3Q9D8S3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arfgap3Q9D8S3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap3Q9D8S3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms