Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms