Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms